本儀器之使用管理委員會「臺灣大學理學院貴重儀器中心－積學館電子顯微鏡管理運作委員會」，組織成員如下：
儀器專家兼召集人：陳俊顯 教授(臺灣大學化學系)
管理委員：林麗瓊 研究員兼中心主任(臺灣大學凝態中心)
管理委員：冀宏源 教授(臺灣大學生化科學研究所)
管理委員會負責：
(1)儀器購置
(2)儀器設備運作與管理
(3)使用規則與收費標準之制訂與修訂
(4)協助培訓人才，視需要開設儀器講習

台大積學館電子顯微鏡室（以下簡稱積學館電顯室）隸屬於台灣大學貴重儀器中心，在國科會等單位資助下，進行全國性的服務。

為增進電子顯微鏡在研究上的發展及使用效益，提昇相關研究的水準，特此成立「台灣大學貴重儀器中心積學館電子顯微鏡室管理運作委員會」(以下簡稱本管理委員會)。

本管理委員會召集人由積學館電顯室儀器專家擔任，另置委員三至五人，由召集人推薦校內外學者專家及使用者組成。管理委員會負責擬定使用辦法，規劃儀器運作與採購等重大事項，並監督積學館電顯室之運作。

積學館電顯室儀器專家由台大理學院貴重儀器中心主任任命，負責該儀器技術諮詢與服務工作之進行，並協助培訓人才。